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Quelques animaux vivant dans le sol ou dans la litière du sol peuvent être directement prélevés à la main : c’est le cas, par exemple, des vers comme les lombrics, de certains insectes comme les fourmis et les larves de hannetons, des mollusques comme les escargots, de certaines araignées, etc.
Cependant, de nombreux êtres vivants contenus dans le sol sont invisibles à l’œil nu : ils constituent la microfaune.
Pour les prélever, on utilise l’appareil de Berlèse. Cet appareil a été mis au point par Antonio Berlèse (1863-1927), entomologiste italien, qui a travaillé sur les insectes nuisibles, notamment ceux des arbres fruitiers.< /p>

• Utilisation de l'appareil de Berlèse

On dépose un échantillon de sol et de litière dans un entonnoir opaque dans lequel est placé un tamis.  On pose l’entonnoir sur un bocal contenant de l’alcool à 70°. On éclaire le dessus de l’entonnoir avec une lampe pendant une à deux semaines.

Les animaux contenus dans l’échantillon de sol vont chercher à fuir la lumière et la chaleur produites par la lampe : ils vont s’enfoncer dans le sol et traverser les mailles du tamis. Ils tombent alors dans l’alcool à 70°, ce qui les tue. On prélève ensuite ces animaux microscopiques flottant à la surface de l’alcool à l’aide d’un compte goutte et on en verse le contenu dans un verre de montre pour l'observer à la loupe binoculaire.