Dans une même espèce, similitude entre gènes différents
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Que s'est-il passé au niveau des gènes ? Comment des gènes peuvent-ils être apparentés ?
Ces gènes apparentés occupent des loci différents au niveau du génome et ne doivent pas être confondus avec les allèles qui, eux, sont situés au même locus (les différentes allèles d'un même gène sont toujours au même emplacement sur un chromosome : le locus).
Tous ces gènes dérivent d'un seul et unique gène ancestral qui aurait subi de nombreuses duplications (= copies) et des mutations indépendantes : on obtient finalement des gènes différents mais très similaires. Le mécanisme précis qui décrit la formation de ces familles multigéniques est expliqué dans un autre chapitre. On admet que 20 % au moins de similitude entre deux protéines indique une origine commune. De plus, le degré de similitude entre deux gènes renseigne sur le temps écoulé depuis la copie du gène ancestral, si on admet que les mutations se produisent avec une fréquence faible mais régulière, et qu'elles s'accumulent au fil du temps : plus les gènes sont semblables, plus la duplication dont ils sont issus est récente.
L'accumulation de mutations dans un gène fait apparaître de nouvelles fonctions.
Les innovations génétiques sont à l'origine du polymorphisme actuel. Ces innovations génétiques sont aléatoires, leur évolution dépend de la sélection naturelle.
L'étude des séquences en acides aminés de telles protéines et des séquences en nucléotides des gènes permet de déterminer le degré de parenté entre les molécules.
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